Der Wohnbereich des Palazzo Pfanner ist der einzige Teil des Bauwerks, der aktuell zu besichtigen ist. Zu ihm gehören ein weitläufiger zentraler Salon, der in den zwanziger Jahren des 18. Jahrhunderts durch den 'Quadraturista'-Maler Pietro Paolo Scorsini mit Fresken ausgemalt wurde, und einige Seitengemächer, die reich ausgestattet sind mit historischen Möbeln, wertvollen Gerätschaften, sakralen Objecten und einer Holzstatue des Erzengels Michael aus dem 14. Jahrhundert.

In den Wohnräumen ist eine Dauerausstellung von medizinisch-chirurgischen Instrumenten und historischen Textdokumenten der Medizin untergebracht.  Sie stammen aus dem Besitz von Pietro Pfanner (1864-1935), der als Chirurg, Philantrop und von 1920 bis 1922 als Bürgermeister von Lucca wirkte.